Kaimei
Kaimei

Vietnam Japan AI Hackathon 2026 · Summary 1 / 2 · What & Why

OSK LAB · Kaimei

Phòng lab tính toán nơi agent và nhà sinh học cùng khám phá nhiều hơn, nhanh hơn.

01Problem

  • Đưa một thuốc mới ra thị trường mất 10-15+ năm, và 90% ứng viên thuốc thất bại khi đã thử trên người (lâm sàng).
  • Bốn giai đoạn đầu, trước khi thử trên người, tốn 33% chi phí nhưng quyết định hợp chất nào được đi tiếp cho giai đoạn downstream.
  • Ở các giai đoạn này, nhà khoa học phải tự kết nối nhiều phần mềm và cơ sở dữ liệu rời rạc, lại cần máy GPU cấu hình lớn để vận hành.

02Solution

  • Nhà khoa học đặt câu hỏi bằng lời, AI agent lập kế hoạch (plan) và chỉ chạy khi nhà khoa học đã duyệt.
  • Agent điều phối chia việc cho sub-agent chuyên môn chạy song song: Tìm đích protein gây bệnh, Dự đoán cấu trúc Protein 3D, Dự đoán phân tử gắn vào protein & ADMET, Research tài liệu bài báo.
  • Các bước thực hiện trở thành các pipeline node trên canvas, cuối phiên có báo cáo tổng hợp và ghi nguồn cho từng số liệu.

03Why AI & Why Now

  • Khám phá thuốc không có công thức cố định, nên cần agent biết đọc ngữ cảnh và linh hoạt tự chọn bước tiếp theo để khám phá.
  • Nay một agent có thể đọc tài liệu và gọi 15+ model AI sinh học và công cụ dữ liệu trên Cloud GPU trong cùng một phiên.
  • Plan đã duyệt được lưu thành quy trình (pipeline) để chạy lại với dữ liệu và thử nghiệm khác.

04Target Users & Opportunity

  • Nhà khoa học tìm thuốc mới ở công ty công nghệ sinh học (biotech), công ty dược (pharma) và lab đại học.
  • User giao tiếp trực tiếp với agent để đưa ra yêu cầu nghiên cứu và phân tích, không cần thành thạo nhiều công cụ hay tự có GPU.
  • Lab nhỏ được dùng công cụ tính toán hiệu suất cao, với chi phí vận hành tối ưu hơn.
Kaimei

Vietnam Japan AI Hackathon 2026 · Summary 2 / 2 · How & Proof

Cách Hoạt Động & Bằng Chứng

Một phiên agent đi từ câu hỏi nghiên cứu tới báo cáo có nguồn.

01How It Works

  • 1Web app (Next.js) gửi câu hỏi tới API (FastAPI), mở một phiên agent (LangGraph trên Temporal).
  • 2Agent điều phối dùng LLM tier 1/2 (Opus 5.5, GPT-6.1 Sol) lập plan cho nhà khoa học duyệt, rồi giao việc cho bốn sub-agent tier 2/3 (Sonnet 5.5, GPT-6 Luna) qua 20+ skill.
  • 3Skill chạy code Python trong sandbox kín (Docker), gọi model GPU qua NVIDIA NIM (Boltz-2, DiffDock), lấy dữ liệu protein và hoạt chất từ UniProt, ChEMBL qua egress proxy.
  • 4Trace, plan và file ghi vào cơ sở dữ liệu (PostgreSQL) và kho lưu trữ, review agent kiểm cả nguồn lẫn nội dung trước khi vào báo cáo.

02What Was Built

  • MVP: canvas chứa các nodes được kết nối thành pipeline, agent với 20+ skill và 15+ model và công cụ, sandbox kín, Trace để xem lại từng bước.
  • Demo Day: một phiên về EGFR, protein đích trong ung thư phổi, hỗ trợ tính toán ở bốn giai đoạn đầu: chọn đích, sàng lọc, tối ưu phân tử và tiền lâm sàng.
  • Cuối phiên là báo cáo có nguồn và các file kết quả (Report & Artifacts), để nhà khoa học xem lại và chọn bước tiếp.

03Results & Evidence

  • Đầu ra demo EGFR: bảng xếp hạng phân tử theo hoạt tính đo trong ChEMBL (pChEMBL), cờ rủi ro tim (hERG), gan (DILI) do model dự đoán và báo cáo có nguồn.
  • Benchmark trên bộ Biomni-Eval1 và LAB-Bench DbQA trước Demo Day.
  • Mỗi số trong báo cáo dẫn về nguồn (ChEMBL, UniProt, RCSB) và output của công cụ tạo ra số đó.

04Team & Next Steps

  • Nghia Pham · Leader, PO, Engineer.
  • Hue Lam · Business Analyst, Tester.
  • Tháng 11/2026: tối ưu chi phí LLM, chạy benchmark. Năm 2027: thêm giai đoạn, bản dùng thử cho lab.
Canvas & Nodes: các bước thực thi thành pipeline